Penasaran apa itu S yang membedakan
jenis ribosom subunit besar dan kecil atau yang ada di sel eukariot dan
prokariot… Dari beberapa sumber (Wikipedia, forum tanya jawab,
dll), maka sedikit saya rangkumkan penjelasannya...
S adalah suatu koefisien yang
mengungkapkan kecepatan molekul untuk membentuk sedimen setelah diproses dengan
teknik ultrasentrifugasi (S bukanlah besaran SI untuk kecepatan sedimentasi).
S adalah Svedberg, satuannya detik
(second atau s).
1 S =
10-13 s
 |
Theodor Svedberg (1884-1971)
Swedish physical chemist |
Rumus Svedberg:
S =
m(1- ῡρ)/ƒ
Dari rumus di atas diketahui bahwa Svedberg (S) berbanding lurus dengan massa molekul (m), densitas molekul (ῡ),
densitas solut (ρ), dan berbanding terbalik dengan koefisien bentuk molekul (ƒ).
Besaran S tidak hanya untuk mengukur
ribosom saja, bisa untuk molekul yang lain.
Contoh pada ribosom 80 S, artinya ribosom
tersebut setelah disentrifus dengan gaya sentrifugal relatif (RCF atau g) 106
kali gravitasi bumi (106 x 9,8 m/s2 atau = ± 107
m/s2), maka akan membentuk sedimen di dasar tabung sentrifus dalam
waktu 80.10-13 s.
Sehingga kecepatan sedimentasi
ribosom 80 S adalah
v =
g.t
=
107 x 80.10-13
=
80.10-6 m/s
=
80 μm/s
Pada ribosom 70 S, dengan perhitungan yang sama seperti di atas, kecepatan
sedimentasinya adalah 70 μm/s.
Ribosom mana yang paling cepat membentuk
sedimen (pellet)???
80 S (80 μm/s) atau 70 S (70 μm/s)?
Jawabannya tentu saja ribosom 80 S
(v 80 S > v 70 S).
Note:
RCF = 0.00001118 × r × N2
Dimana:
r = radius rotor (cm)
N = kecepatan rpm.